HWND FindWindow(
  LPCTSTR lpClassName,  // class name，窗口的类名称
  LPCTSTR lpWindowName  // window name，窗口标题名称
);

使用时，两者只要知道一个就可以定位到你想要的窗口上了，若两个参数都为NULL，则搜索所有启动的进程，这里，为了获取应用程序的窗口信息，可以使用Spy++（微软vs自带工具，没有的话请自行下载），这个软件很好用，可以获得窗口类名称，标题等信息（还可以监视窗口消息）。

//FindWindowEx：用于获取应用程序中指定子窗口的句柄
HWND FindWindowEx(
  HWND hwndParent,      // handle to parent window，应用程序窗口句柄
  HWND hwndChildAfter,  // handle to child window，子窗口的句柄
  LPCTSTR lpszClass,    // class name，子窗口类
  LPCTSTR lpszWindow    // window name，子窗口标题
);

2、WindowFromPoint：利用WindowFromPoint函数得到指定坐标点所在的窗口句柄，这种方法不依赖窗口信息。

void CDlgSpy::OnMouseMove(UINT nFlags, CPoint point)
{
	POINT pnt;

	::GetCursorPos(&pnt);
	HWND hwndCur = ::WindowFromPoint(pnt);

    //...
}

其次，得到窗口句柄后移动窗口的方法：

//等待启动完毕
HWND hMain = NULL;
while(1)
{
	if (hMain = ::FindWindow(NULL, "窗口标题"))
	{
		CRect rect, rectDlg;
		pMainFrame->GetWindowRect(&rect);
		::GetWindowRect(hMain, rectDlg);

		::SetWindowPos(hMain, NULL, rect.right-10, rect.top, rectDlg.Width(), rectDlg.Height(), SWP_SHOWWINDOW | SWP_NOSIZE);
		break;
	}
}